1、防治骨質疏松

骨質是由維生素K2和優質蛋白質先形成骨元蛋白，再與鈣生成骨質，蓄積骨中，增加骨密度這三大要素缺一不可。納豆中包含大豆異黃酮和維生素K2，大豆異黃酮能防止骨中鈣的溶解，而維生素K2則能夠將鈣固定于骨中。也就是說，大豆異黃酮和維生素K2的組合能相互協力，起到強骨的作用。

2、調節血脂

納豆可以抑制血中的LDL氧化，有效降低總膽固醇以及三酸甘油酯的濃度，進而減少粥狀動脈硬化的發生。同時，抑制和減少血管緊張素II的合成，減輕血管外周阻力，進而達到降脂降壓的目的。

3、調解腸胃

大豆的蛋白質具有不溶解性，做成納豆后，變得可溶，并產生氨基酸，原料中不存在的各種酵素，由于納豆菌及關聯益生菌產生，可以幫助腸胃消化吸收。發酵后的豆制品，蛋白質的利用率提高，妨礙消化吸收的比率會降低。

4、排毒養顏

納豆不受胃液的強酸影響，它能很快在腸道內定植并產生吡啶二羧酸，有助于殺滅、抑制腸道內的有害菌和病毒。納豆的粗提物中含有豐富的卵磷脂、不飽和脂肪酸、維生素E等抗氧化成分，可有效降低血脂、膽固醇及清除腦組織細胞中過氧化質色素，調節皮膚細胞和皮膚表面水和脂肪的平衡，促進血液循環，改善皮膚彈性，令皮膚光潔柔軟，達到延緩衰老之功效。

5、調節血糖

餐后血糖值出現明顯下降趨勢，是非常直觀的。一是納豆菌吞噬葡萄糖和粘物質的作用，二是納豆中的高彈性蛋白酶（或稱胰肽酶E，Elastase），抑制了血糖增加。它具有與豬胰臟所含的這種酶的作用，而豬胰腺的彈性蛋白酶已用于高血糖的治療藥物。

6、瘦身減肥

納豆中的粘液素具有與膳食纖維相似的作用，它能減少人體對脂肪的吸收。另外，納豆中的維生素K2支持體內脂肪燃燒，防止脂肪在體內堆積，從而起到瘦身減肥的作用。納豆菌在腸內大約能堅持1周左右，可以促進其它有益菌增殖。人體吸收的營養就成為腸內細菌的餌食而被吞噬，再加上納豆激酶可燃燒脂肪，就能減肥。